Lo que está claro es que trás la enfermedad celíaca, subyace casi siempre, una condición de hiper permeabilidad intestinal, es decir un incremento anormal de la permeabilidad de la pared del intestino, gracias a la cual, logran entrar a la corriente sanguínea, elementos potencialmente peligrosos como fragmentos de alimentos mal digeridos, microorganismos y bacterias. También se ha observado, que en personas sensibles al gluten, la barrera hematoencefálica, no desempeña bien s